Искон. Преф. производное от той же основы, что и тоня «рыбачий стан, пристань», тонуть. Буквально — «пристань, бухта», затем — «пристанище, убежище, приют». Ср. затон.
Школьный этимологический словарь русского языка. Происхождение слов. — М.: Дрофа
Н. М. Шанский, Т. А. Боброва
2004