Искон. Преф. производное (ср. уют, удел) от щелье, суф. образования от щель. См. щель, скала. Ущелье буквально — «расщелина между горами».
Школьный этимологический словарь русского языка. Происхождение слов. — М.: Дрофа
Н. М. Шанский, Т. А. Боброва
2004