Толковый словарь Ефремовой - прото-

Словообразовательная единица, образующая: 1) имена существительные названия церковных должностей со значением старшинства в звании (протодиакон, протоиерей, протопоп и т.п.); 2) имена существительные названия лиц, означающие высшую степень проявления ими какого-л. качества, заключенного в мотивирующем имени существительном (протобестия, протоканалья).

2. префикс

Словообразовательная единица, образующая имена существительные со значением первоначальности, исконности по отношению к тому, что названо мотивирующим именем существительным (протозвёзды, протозоология, протоистория, прототип и т.п.). .