Словарь русских фамилий - пупышев
Пупышев
Пупырь, пупыш волдырь, шишка; отсюда и человек с такой приметой. Иногда малыш, карапуз. Когда в романе Достоевского 'Братья Карамазовы' гимназист Коля Красоткин назвал служанку Агафью 'женский пол', та возмутилась и ответила: 'Женский пол, ишь, пупырь!'.(Ф) В вологодских говорах пупыш 'прыщ', переносно 'зазнайка', 'выскочка'.
В Сл. Даля пупыш 'зародыш; цветочная головка'. Но вряд ли фамилия происходит непосредственно из этого слова, разве что через переходные звенья. Может быть, она связана с прозвищем Пупыш, отчество от которого закрепилось в качестве фамилии, равнозначно с пупырь ('прыщ') 'гордец, воображающий себя превосходящим всех'. Фамилия была частой на Северной Двине.
(Н)
Пупырь, пупыш 'прыщ, волдырь'; в некоторых говорах так назвают упитанного ребена, карапуза (в петербургсих и смоленских говорах пупа ласковое обращение к маленьким детям). Вероятно, такие прозвища могли получить люди невысокие, полные так, в смоленских говорах родственне слова пупел, пуплуше имеют значение 'небольшой, коротенький, малорослый'.
Кроме того, пупырь 'гордец, воображающий себя выше всех', а кое-где 'угрюмый, неразговорчивый человек'. (Г)В Ономастиконе Весловского есть Пупыш, несколько лиц в Новгороде, XVI в.; Пятый Пупышев, крестьянин, 1624 г., Соль Вычегодская. .