Этимологический словарь русского языка - кишка

Общеслав. Уменьшит.-ласкат. суф. производное от *kyša — тж., образованного посредством суф. -j- от той же основы, что и киснуть, кислый. Исходно — «что-л. прокисающее, портящееся», затем — «такой внутренний орган, кишка, желудок» (ср. чешск. диал. kyška «свернувшееся, скисшее молоко»).

Школьный этимологический словарь русского языка. Происхождение слов. — М.: Дрофа

Н. М. Шанский, Т. А. Боброва

2004