Этимологический словарь русского языка - недра

Общеслав. Образовалось из vъn ědra «внутри, в глубине» в результате переразложения на стыке предлога и сущ.: vъn ědra > въ недра (ср. в нем, см. он). Исходное ědro «лоно, грудь, глубина» — того же корня, что греч. ētor «сердце», нем. Ader «жила».

Школьный этимологический словарь русского языка. Происхождение слов. — М.: Дрофа

Н. М. Шанский, Т. А. Боброва

2004