Этимологический словарь русского языка - нетопырь

Общеслав. Объясняется обычно как сложение основ *nekto (> нето) и pyrъ, родственных соответственно словам ночь (< *noktis, с перегласовкой о/е) и парить «летать», перо, выспренный (с перегласовкой ы — а (ступень продления о) — е — ь — пьр (ступень редукции о). В таком случае нетопырь буквально — «летающий ночью».

Школьный этимологический словарь русского языка. Происхождение слов. — М.: Дрофа

Н. М. Шанский, Т. А. Боброва

2004