Химическая энциклопедия - ферментативных реакций кинетика
Ферментативных реакций кинетика
изучает закономерности протекания во времени ферментативных р-ций, а также их механизм; раздел кинетики химической.
Каталитич. цикл конверсии в-ва S (субстрата) в продукт P под действием фермента E протекает с образованием промежут. соед. Xi:
где ki - константы скорости отдельных элементарных стадий, константа равновесия образования фермент-субстратного комплекса X1 (ES, комплекс Михаэлиса).
При данной т-ре скорость р-ции зависит от концентраций фермента, субстрата и состава среды. Различают стационарную, предстационарную и релаксационную кинетику ферментативных р-ций.
Стационарная кинетика. В стационарном состоянии по промежуточным соед. (dXi/dt = 0, i = 1, ..., n) и при избытке субстрата , где [S]0 и [E]0 начальные концентрации соотв. субстрата и фермента, кинетика процесса характеризуется постоянным, неизменным во времени уровнем концентраций промежут. соед., а выражение для скорости процесса v0, наз. начальной стационарной скоростью, имеет вид (ур-ние МихаэлисаМентен):
(1)
где значения k кат и К м -> ф-ции констант скорости элементарных стадий и заданы ур-нениями:
Величину k кат наз. эффективной каталитич. константой скорости процесса, параметр К м -> константой Михаэлиса. Значение k кат определяется величинами численно равна концентрации субстрата, при к-рой скорость р-ции равна , поэтому К м часто служит мерой сродства субстрата и фермента, однако это справедливо лишь, если
Величины К м > и + K'b/>[H+] -т. наз. рН-ф-ции Михаэлиса, а К а, К b и К'a, K'b-> константы ионизации групп аи bсоотв. своб. фермента и фермент-субстратного комплекса. В координатах lg , b, а n -> ф-ции элементарных констант скорости; -корни соответствующего характеристич. ур-ния.
Величина, обратная , наз. характеристич. временем процесса:
Для р-ции, протекающей с участием nпромежут. соед., можно получить nхарактеристич. времен.
Исследование кинетики ферментативной р-ции в предстационарном режиме позволяет получить представление о детальном механизме каталитич. цикла и определить константы скорости элементарных стадий процесса.
Экспериментально кинетику ферментативной р-ции в предстационарном режиме исследуют с помощью метода остановленной струи (см. Струевые кинетические методы), позволяющего смешивать компоненты р-ции в течение 1 мс.
Релаксационная кинетика. При быстром возмущающем воздействии на систему (изменение т-ры, давления, электрич. поля) время, к-рое необходимо системе для достижения нового равновесия или стационарного состояния, зависит от скорости процессов, определяющих каталитич. ферментативный цикл.
Система ур-ний, описывающая кинетику процесса, линейна, если смещение от положения равновесия невелико. Решение системы приводит к зависимостям концентраций компонентов разл. стадий процесса в виде суммы экспоненциальных членов, показатели экспонент к-рых имеют характер времен релаксаций. Результатом исследования является спектр времен релаксации, соответствующий числу промежут. соед., участвующих в процессе. Величины времен релаксаций зависят от констант скорости элементарных стадий процессов.